Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gjb5Q02739 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms