Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms