Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psme1P97371 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Psme1P97371 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psme1P97371 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psme1P97371 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psme1P97371 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psme1P97371 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Psme1P97371 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psme1P97371 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Psme1P97371 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Psme1P97371 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Psme1P97371 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Psme1P97371 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psme1P97371 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psme1P97371 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psme1P97371 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psme1P97371 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psme1P97371 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psme1P97371 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psme1P97371 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psme1P97371 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psme1P97371 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psme1P97371 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psme1P97371 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Psme1P97371 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Psme1P97371 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psme1P97371 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psme1P97371 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psme1P97371 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psme1P97371 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms