Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms