Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tubg1P83887 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms