Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad50P70388 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad50P70388 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad50P70388 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad50P70388 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad50P70388 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad50P70388 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad50P70388 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad50P70388 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad50P70388 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad50P70388 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms