Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf5P70191 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf5P70191 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf5P70191 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf5P70191 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf5P70191 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf5P70191 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf5P70191 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf5P70191 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf5P70191 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf5P70191 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf5P70191 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf5P70191 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms