Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Paxbp1P58501 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms