Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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Dpf3P58269 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Dpf3P58269 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Dpf3P58269 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Dpf3P58269 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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