Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtnsP57757 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtnsP57757 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtnsP57757 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtnsP57757 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtnsP57757 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtnsP57757 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtnsP57757 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtnsP57757 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtnsP57757 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtnsP57757 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtnsP57757 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtnsP57757 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms