Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PctpP53808 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PctpP53808 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PctpP53808 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PctpP53808 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PctpP53808 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PctpP53808 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PctpP53808 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PctpP53808 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PctpP53808 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PctpP53808 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PctpP53808 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PctpP53808 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PctpP53808 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PctpP53808 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PctpP53808 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PctpP53808 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PctpP53808 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PctpP53808 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PctpP53808 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PctpP53808 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PctpP53808 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PctpP53808 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PctpP53808 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PctpP53808 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PctpP53808 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PctpP53808 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PctpP53808 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PctpP53808 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PctpP53808 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PctpP53808 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PctpP53808 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PctpP53808 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PctpP53808 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PctpP53808 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PctpP53808 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PctpP53808 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PctpP53808 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PctpP53808 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PctpP53808 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PctpP53808 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PctpP53808 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PctpP53808 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PctpP53808 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PctpP53808 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PctpP53808 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PctpP53808 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PctpP53808 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PctpP53808 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PctpP53808 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PctpP53808 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PctpP53808 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PctpP53808 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PctpP53808 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PctpP53808 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PctpP53808 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PctpP53808 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PctpP53808 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PctpP53808 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PctpP53808 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PctpP53808 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PctpP53808 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PctpP53808 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PctpP53808 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PctpP53808 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PctpP53808 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PctpP53808 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PctpP53808 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PctpP53808 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PctpP53808 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PctpP53808 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PctpP53808 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PctpP53808 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PctpP53808 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PctpP53808 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PctpP53808 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PctpP53808 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PctpP53808 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PctpP53808 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PctpP53808 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PctpP53808 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PctpP53808 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PctpP53808 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PctpP53808 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PctpP53808 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PctpP53808 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PctpP53808 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PctpP53808 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PctpP53808 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PctpP53808 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PctpP53808 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PctpP53808 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PctpP53808 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PctpP53808 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PctpP53808 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PctpP53808 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PctpP53808 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PctpP53808 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PctpP53808 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PctpP53808 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms