Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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