Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epb41P48193 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Epb41P48193 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epb41P48193 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epb41P48193 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Epb41P48193 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epb41P48193 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epb41P48193 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Epb41P48193 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epb41P48193 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epb41P48193 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epb41P48193 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epb41P48193 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Epb41P48193 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Epb41P48193 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Epb41P48193 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epb41P48193 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epb41P48193 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epb41P48193 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epb41P48193 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epb41P48193 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epb41P48193 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epb41P48193 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epb41P48193 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epb41P48193 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epb41P48193 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epb41P48193 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epb41P48193 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epb41P48193 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epb41P48193 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epb41P48193 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epb41P48193 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epb41P48193 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epb41P48193 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41P48193 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41P48193 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41P48193 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb41P48193 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb41P48193 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb41P48193 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb41P48193 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb41P48193 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms