Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tnfsf9P41274 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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