Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TtlP38585 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TtlP38585 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TtlP38585 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TtlP38585 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TtlP38585 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TtlP38585 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
TtlP38585 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TtlP38585 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TtlP38585 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TtlP38585 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TtlP38585 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TtlP38585 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TtlP38585 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TtlP38585 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TtlP38585 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TtlP38585 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TtlP38585 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
TtlP38585 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TtlP38585 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TtlP38585 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TtlP38585 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TtlP38585 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TtlP38585 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TtlP38585 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TtlP38585 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TtlP38585 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TtlP38585 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
TtlP38585 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TtlP38585 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TtlP38585 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TtlP38585 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TtlP38585 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TtlP38585 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TtlP38585 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TtlP38585 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
TtlP38585 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TtlP38585 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TtlP38585 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TtlP38585 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TtlP38585 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TtlP38585 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TtlP38585 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TtlP38585 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TtlP38585 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TtlP38585 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TtlP38585 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TtlP38585 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TtlP38585 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TtlP38585 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TtlP38585 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TtlP38585 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TtlP38585 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TtlP38585 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TtlP38585 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TtlP38585 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TtlP38585 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TtlP38585 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TtlP38585 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TtlP38585 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TtlP38585 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TtlP38585 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TtlP38585 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TtlP38585 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TtlP38585 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TtlP38585 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TtlP38585 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
TtlP38585 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TtlP38585 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TtlP38585 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TtlP38585 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TtlP38585 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TtlP38585 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TtlP38585 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TtlP38585 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
TtlP38585 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
TtlP38585 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TtlP38585 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TtlP38585 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TtlP38585 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TtlP38585 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TtlP38585 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TtlP38585 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TtlP38585 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TtlP38585 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TtlP38585 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TtlP38585 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TtlP38585 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TtlP38585 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TtlP38585 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TtlP38585 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TtlP38585 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
TtlP38585 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TtlP38585 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TtlP38585 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TtlP38585 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TtlP38585 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TtlP38585 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TtlP38585 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TtlP38585 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms