Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin1P35438 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grin1P35438 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms