Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn11P35235 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn11P35235 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.5 ms