Protein–RNA interactions for Protein: P32067

Ssb, Lupus La protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SsbP32067 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SsbP32067 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SsbP32067 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SsbP32067 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SsbP32067 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SsbP32067 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SsbP32067 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SsbP32067 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SsbP32067 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SsbP32067 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SsbP32067 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SsbP32067 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SsbP32067 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SsbP32067 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SsbP32067 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SsbP32067 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SsbP32067 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SsbP32067 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SsbP32067 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SsbP32067 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SsbP32067 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SsbP32067 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SsbP32067 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SsbP32067 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SsbP32067 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SsbP32067 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SsbP32067 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SsbP32067 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SsbP32067 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SsbP32067 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SsbP32067 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SsbP32067 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SsbP32067 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SsbP32067 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SsbP32067 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SsbP32067 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SsbP32067 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SsbP32067 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SsbP32067 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SsbP32067 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SsbP32067 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SsbP32067 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SsbP32067 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SsbP32067 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SsbP32067 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SsbP32067 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SsbP32067 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SsbP32067 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SsbP32067 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SsbP32067 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SsbP32067 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SsbP32067 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SsbP32067 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SsbP32067 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SsbP32067 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SsbP32067 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SsbP32067 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SsbP32067 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SsbP32067 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SsbP32067 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SsbP32067 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SsbP32067 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SsbP32067 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SsbP32067 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SsbP32067 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SsbP32067 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SsbP32067 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SsbP32067 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SsbP32067 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SsbP32067 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SsbP32067 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SsbP32067 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SsbP32067 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SsbP32067 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SsbP32067 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SsbP32067 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SsbP32067 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SsbP32067 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SsbP32067 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SsbP32067 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SsbP32067 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SsbP32067 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SsbP32067 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SsbP32067 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SsbP32067 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SsbP32067 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SsbP32067 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SsbP32067 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SsbP32067 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SsbP32067 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SsbP32067 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SsbP32067 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SsbP32067 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SsbP32067 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SsbP32067 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SsbP32067 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SsbP32067 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SsbP32067 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SsbP32067 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SsbP32067 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms