Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
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