Protein–RNA interactions for Protein: P23440

Pde6b, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, mousemouse

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Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6bP23440 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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Pde6bP23440 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms