Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RarbP22605 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RarbP22605 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RarbP22605 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RarbP22605 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RarbP22605 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RarbP22605 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RarbP22605 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RarbP22605 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RarbP22605 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RarbP22605 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RarbP22605 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RarbP22605 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RarbP22605 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RarbP22605 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RarbP22605 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RarbP22605 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RarbP22605 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RarbP22605 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RarbP22605 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RarbP22605 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RarbP22605 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RarbP22605 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RarbP22605 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RarbP22605 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RarbP22605 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RarbP22605 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RarbP22605 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RarbP22605 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RarbP22605 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RarbP22605 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RarbP22605 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RarbP22605 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RarbP22605 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RarbP22605 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RarbP22605 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RarbP22605 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RarbP22605 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RarbP22605 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RarbP22605 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RarbP22605 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RarbP22605 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RarbP22605 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RarbP22605 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RarbP22605 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RarbP22605 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RarbP22605 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RarbP22605 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RarbP22605 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RarbP22605 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RarbP22605 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RarbP22605 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RarbP22605 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RarbP22605 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RarbP22605 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RarbP22605 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RarbP22605 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RarbP22605 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RarbP22605 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RarbP22605 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RarbP22605 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RarbP22605 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RarbP22605 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RarbP22605 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RarbP22605 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RarbP22605 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RarbP22605 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RarbP22605 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RarbP22605 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RarbP22605 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RarbP22605 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RarbP22605 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RarbP22605 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RarbP22605 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RarbP22605 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RarbP22605 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RarbP22605 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RarbP22605 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RarbP22605 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RarbP22605 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RarbP22605 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RarbP22605 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RarbP22605 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RarbP22605 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RarbP22605 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RarbP22605 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RarbP22605 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RarbP22605 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RarbP22605 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RarbP22605 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RarbP22605 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RarbP22605 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RarbP22605 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RarbP22605 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RarbP22605 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RarbP22605 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RarbP22605 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RarbP22605 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RarbP22605 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RarbP22605 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms