Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb9P20615 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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