Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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