Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RhoP15409 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RhoP15409 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RhoP15409 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RhoP15409 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RhoP15409 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RhoP15409 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
RhoP15409 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RhoP15409 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RhoP15409 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RhoP15409 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RhoP15409 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RhoP15409 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RhoP15409 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC14□□□□□ -0.17
RhoP15409 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC14□□□□□ -0.17
RhoP15409 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RhoP15409 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC14□□□□□ -0.17
RhoP15409 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
RhoP15409 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RhoP15409 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RhoP15409 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RhoP15409 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RhoP15409 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RhoP15409 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RhoP15409 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RhoP15409 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RhoP15409 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC14□□□□□ -0.17
RhoP15409 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RhoP15409 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RhoP15409 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RhoP15409 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RhoP15409 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RhoP15409 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RhoP15409 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RhoP15409 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RhoP15409 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RhoP15409 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RhoP15409 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RhoP15409 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RhoP15409 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RhoP15409 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RhoP15409 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RhoP15409 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RhoP15409 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RhoP15409 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RhoP15409 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RhoP15409 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RhoP15409 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RhoP15409 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RhoP15409 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RhoP15409 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RhoP15409 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RhoP15409 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RhoP15409 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
RhoP15409 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
RhoP15409 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
RhoP15409 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RhoP15409 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RhoP15409 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RhoP15409 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RhoP15409 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RhoP15409 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RhoP15409 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RhoP15409 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RhoP15409 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RhoP15409 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RhoP15409 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RhoP15409 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RhoP15409 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RhoP15409 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RhoP15409 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RhoP15409 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RhoP15409 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RhoP15409 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RhoP15409 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RhoP15409 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RhoP15409 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RhoP15409 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RhoP15409 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RhoP15409 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RhoP15409 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RhoP15409 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RhoP15409 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RhoP15409 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RhoP15409 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RhoP15409 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RhoP15409 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RhoP15409 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RhoP15409 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RhoP15409 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RhoP15409 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RhoP15409 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RhoP15409 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RhoP15409 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RhoP15409 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RhoP15409 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RhoP15409 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RhoP15409 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RhoP15409 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RhoP15409 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms