Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P10404 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P10404 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
P10404 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
P10404 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
P10404 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
P10404 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
P10404 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P10404 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P10404 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P10404 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P10404 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P10404 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P10404 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P10404 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P10404 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P10404 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P10404 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P10404 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P10404 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P10404 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P10404 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P10404 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P10404 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P10404 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P10404 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P10404 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P10404 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
P10404 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
P10404 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P10404 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P10404 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
P10404 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P10404 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
P10404 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P10404 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P10404 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P10404 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P10404 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P10404 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P10404 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P10404 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P10404 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P10404 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P10404 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P10404 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P10404 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P10404 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P10404 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
P10404 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
P10404 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P10404 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
P10404 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P10404 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P10404 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P10404 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P10404 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P10404 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P10404 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P10404 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P10404 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
P10404 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
P10404 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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P10404 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
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P10404 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
P10404 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P10404 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
P10404 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P10404 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P10404 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P10404 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P10404 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P10404 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P10404 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P10404 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P10404 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P10404 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P10404 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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