Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PolP10400 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PolP10400 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PolP10400 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PolP10400 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PolP10400 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PolP10400 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PolP10400 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PolP10400 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PolP10400 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PolP10400 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PolP10400 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PolP10400 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PolP10400 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PolP10400 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PolP10400 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PolP10400 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PolP10400 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PolP10400 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PolP10400 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PolP10400 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PolP10400 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PolP10400 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PolP10400 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PolP10400 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PolP10400 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PolP10400 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PolP10400 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PolP10400 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PolP10400 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PolP10400 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PolP10400 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PolP10400 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PolP10400 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PolP10400 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PolP10400 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PolP10400 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PolP10400 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PolP10400 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PolP10400 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PolP10400 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PolP10400 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PolP10400 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PolP10400 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PolP10400 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PolP10400 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PolP10400 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PolP10400 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PolP10400 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PolP10400 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PolP10400 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PolP10400 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PolP10400 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PolP10400 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PolP10400 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PolP10400 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PolP10400 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PolP10400 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PolP10400 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PolP10400 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PolP10400 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PolP10400 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PolP10400 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PolP10400 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PolP10400 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PolP10400 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PolP10400 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PolP10400 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PolP10400 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PolP10400 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PolP10400 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PolP10400 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PolP10400 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PolP10400 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PolP10400 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PolP10400 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PolP10400 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PolP10400 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PolP10400 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PolP10400 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PolP10400 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PolP10400 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PolP10400 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PolP10400 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PolP10400 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PolP10400 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PolP10400 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PolP10400 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PolP10400 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PolP10400 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PolP10400 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PolP10400 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PolP10400 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PolP10400 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PolP10400 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PolP10400 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PolP10400 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PolP10400 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PolP10400 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PolP10400 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms