Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Amd1P0DMN7 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.1 ms