Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Itgb1P09055 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms