Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TnfP06804 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TnfP06804 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TnfP06804 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TnfP06804 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TnfP06804 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TnfP06804 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TnfP06804 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TnfP06804 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TnfP06804 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TnfP06804 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TnfP06804 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TnfP06804 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TnfP06804 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TnfP06804 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TnfP06804 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TnfP06804 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TnfP06804 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TnfP06804 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TnfP06804 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TnfP06804 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TnfP06804 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TnfP06804 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TnfP06804 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TnfP06804 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TnfP06804 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TnfP06804 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TnfP06804 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TnfP06804 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TnfP06804 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TnfP06804 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TnfP06804 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TnfP06804 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TnfP06804 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TnfP06804 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TnfP06804 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TnfP06804 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TnfP06804 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TnfP06804 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TnfP06804 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TnfP06804 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TnfP06804 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TnfP06804 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TnfP06804 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TnfP06804 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TnfP06804 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TnfP06804 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TnfP06804 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TnfP06804 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TnfP06804 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TnfP06804 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TnfP06804 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TnfP06804 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TnfP06804 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TnfP06804 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TnfP06804 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TnfP06804 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TnfP06804 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TnfP06804 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TnfP06804 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TnfP06804 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TnfP06804 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TnfP06804 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TnfP06804 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TnfP06804 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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TnfP06804 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TnfP06804 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TnfP06804 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TnfP06804 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TnfP06804 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TnfP06804 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TnfP06804 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TnfP06804 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TnfP06804 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TnfP06804 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TnfP06804 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TnfP06804 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TnfP06804 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TnfP06804 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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TnfP06804 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TnfP06804 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TnfP06804 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TnfP06804 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TnfP06804 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TnfP06804 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TnfP06804 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TnfP06804 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TnfP06804 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TnfP06804 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TnfP06804 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TnfP06804 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
TnfP06804 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
TnfP06804 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TnfP06804 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TnfP06804 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TnfP06804 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TnfP06804 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TnfP06804 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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