Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

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Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Copb2O55029 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Copb2O55029 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Copb2O55029 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Copb2O55029 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Copb2O55029 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Copb2O55029 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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