Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
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