Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm29394H3BIW7 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms