Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Gm28038F7BCN9 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Gm28038F7BCN9 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Gm28038F7BCN9 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Gm28038F7BCN9 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Gm28038F7BCN9 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Gm28038F7BCN9 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Gm28038F7BCN9 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Gm28038F7BCN9 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Gm28038F7BCN9 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Gm28038F7BCN9 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Gm28038F7BCN9 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Gm28038F7BCN9 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
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