Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
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