Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms