Protein–RNA interactions for Protein: E9Q623

BC051665, cDNA sequence BC051665, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051665E9Q623 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms