Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccdc71lE9Q4T4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccdc71lE9Q4T4 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccdc71lE9Q4T4 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccdc71lE9Q4T4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccdc71lE9Q4T4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccdc71lE9Q4T4 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccdc71lE9Q4T4 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms