Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms