Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Phf11bB4XVQ1 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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