Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms