Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms