Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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