Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms