Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Grik3B1AS29 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Grik3B1AS29 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms