Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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H2-M5A7VMS3 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
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H2-M5A7VMS3 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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H2-M5A7VMS3 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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H2-M5A7VMS3 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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H2-M5A7VMS3 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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