Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms