Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Lcn6A2AJB9 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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Lcn6A2AJB9 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Lcn6A2AJB9 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lcn6A2AJB9 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lcn6A2AJB9 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Lcn6A2AJB9 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Lcn6A2AJB9 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Lcn6A2AJB9 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Lcn6A2AJB9 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lcn6A2AJB9 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lcn6A2AJB9 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Lcn6A2AJB9 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lcn6A2AJB9 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lcn6A2AJB9 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lcn6A2AJB9 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lcn6A2AJB9 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Lcn6A2AJB9 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lcn6A2AJB9 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lcn6A2AJB9 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lcn6A2AJB9 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Lcn6A2AJB9 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Lcn6A2AJB9 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lcn6A2AJB9 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lcn6A2AJB9 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lcn6A2AJB9 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lcn6A2AJB9 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Lcn6A2AJB9 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lcn6A2AJB9 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lcn6A2AJB9 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Lcn6A2AJB9 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Lcn6A2AJB9 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lcn6A2AJB9 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lcn6A2AJB9 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lcn6A2AJB9 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lcn6A2AJB9 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lcn6A2AJB9 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lcn6A2AJB9 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lcn6A2AJB9 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lcn6A2AJB9 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lcn6A2AJB9 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lcn6A2AJB9 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lcn6A2AJB9 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
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Lcn6A2AJB9 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms