Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Gm13206-201ENSMUST00000129579 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 2810403D21Rik-204ENSMUST00000144421 747 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Gm28430-201ENSMUST00000191031 628 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Gm37293-201ENSMUST00000191658 295 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Ccl12-201ENSMUST00000000194 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 AI506816-201ENSMUST00000197153 474 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Olfr1480-203ENSMUST00000207904 1209 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 AC164624.1-201ENSMUST00000219148 1025 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 AC133517.2-201ENSMUST00000226820 690 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Pdcl2-201ENSMUST00000031145 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Manf-201ENSMUST00000069036 960 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Olfr1480-201ENSMUST00000072219 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Akap7-202ENSMUST00000095779 919 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Lrrc3b-202ENSMUST00000163937 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Gm8872-201ENSMUST00000197475 1341 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Gm2026-201ENSMUST00000109007 1621 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 1700034E13Rik-202ENSMUST00000118724 490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Gm11622-201ENSMUST00000120525 691 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Gm15379-201ENSMUST00000121224 648 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Gm15227-201ENSMUST00000121844 399 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Apela-202ENSMUST00000142822 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 1110015O18Rik-201ENSMUST00000183632 570 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Gm44644-201ENSMUST00000207994 642 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 AC123735.1-201ENSMUST00000227358 605 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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