Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms