Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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